新的液体活检测试可以从一滴血监控

Circulogene治疗诊断已推出到液体活检市场测试,能够丰富从一滴血循环cfDNA监测癌症疗法。索尼娅尼古拉斯的SelectScience ®的临床编辑,采访了陈雄博士叶,Circulogene的首席科学官,以了解更多信息。

肿瘤签名

SN:你能告诉我们什么是无细胞DNA的开始呢?

CY:无细胞的DNA(cfDNA)是已经从细胞中释放的DNA分子。当细胞死去,它们释放它们的细胞内的内容,包括DNA,进入血液。无细胞DNA的概念已经在非侵入性产前检验已应用多年。在肿瘤领域,肿瘤细胞会释放它们的DNA进入血液循环更迅速,由于其高周转率。这些DNA片段代表了遗传足迹或指纹,肿瘤细胞已经落后了。

SN:使用何种cfDNA测试?

CY:外围cfDNA分子包含特定于肿瘤细胞基因组改变。这为我们提供了,对于第一次,以非侵入性的,实时的和纵向的方式(相对于传统的组织活检侵入一时间点,单中心取样)监测肿瘤的异质性和克隆动态演化。临床上,从信息收集cfDNA可以指导治疗决策的临床医生,监测治疗效果,监测微小残留病,耐药性,复发和转移。

完善技术

SN:什么是使用现有的方法cfDNA测试的限制?

CY:对于大样本量,产量低,劳动密集性要求是基于cfDNA测试在临床常规应用程序的所有主要障碍。这样做的原因是,所有公司都使用相同的方法来提取cfDNA,即硅石矩阵基(无论是旋转柱或磁珠)。不幸的是,我们已经相识多年,这一提取过程中丢失了大量的材料,由于结合,洗涤和洗脱步骤。对于学术研究项目,它其实并不重要,但在临床上,起始材料的70-80%的损失意味着最终结果将被大打折扣,从而导致不恰当的病人管理。的影响是巨大的,特别是在癌症患者靶向治疗。

然而,所有的液体活检公司仍在努力完善自己的技术,以选择性富集或从显性正常人群扩增肿瘤特异性cfDNA工作。想象一下,他们的原料仍然是提取/分离过程后幸存下来的“部分”的DNA分子。其结果是,不管他们的技术的敏感程度(下游),它们不能检测期间样品制备步骤(上游)cfDNA已经丢失。这是关键的一点,每个人都在这个领域被忽视甚至忽略。他们不知道自己错过了什么。在另一方面,在Circulogene我们都集中在这第一步,以确保我们捕获所有的cfDNA我们可以的。

SN:请你能描述你的分析cfDNA的专有方法是如何工作的?

CY:我们的理由是在流通,释放cfDNA片段不“裸”,但与蛋白质和脂质复合。这种特殊的属性,不仅转移了浮力密度值从批量染色质,游离DNA或蛋白质的区别不大,而且还通过循环核酸免受攻击保护相应的cfDNA。密度分馏允许我们基于其蛋白质/ DNA比率,即常染色质(活性基因)与异(不活动基因)选择性地分离和浓缩cfDNA片段。

我们的浓度方法能够直接从血浆或血清的液滴体积先进基因组分析(如,新一代测序)(低至20微升通过简单的手指棒)。此协议可应用到广泛的临床基因测试,以最少的样品体积,最大产率,精简和自动工作流具有降低的成本和周转时间的优点。最重要的是,考虑到绝大多数人类基因组的不确实为蛋白质(约98%)代码的事实,基于密度的浓缩技术非常有意义为cfDNA临床应用在其他随机,盲提取方法。

SN:什么是该技术在癌症诊断/治疗的潜在益处?

CY:外卖的消息是这样的-我们的测试结果将有助于肿瘤学家选择正确的治疗方法,对于正确的病人,在正确的时间。

  1. 更灵敏,准确的测试结果是由于原料没有损失。
  2. 更快的周转时间:5-7天(由于自动化程度高)相比,组织活检3-6周,和目前液体活检2-4周。
  3. 比传统的组织活检更便宜(平均$ 15,000名)和电流液体活检试验(平均$ 5,000),减少了病人和医疗保健负担。
  4. 非侵入性的,实时的,纵向监测与侵入,外的日期,单点数据(组织活检)。
通过Circulogene治疗诊断提供表 - 不同类型活检的比较

SN:你能描述一下研究研究你是做什么工作的?

CY:我们正在积极与多家学术研究机构合作,以进一步验证和实施我们的技术。我们将有更多的临床验证数据在明年上市。

SN:是测试批准用于临床吗?

CY:是的,它被批准。Circulogene是CLIA认证的临床实验室,我们目前正在处理的临床标本。

 

关于陈雄博士叶

陈雄博士叶拥有超过20年的药物发现和生物技术,制药分子诊断和诊断行业的经验。他曾在辉瑞,响应遗传学,Quest Diagnostics公司的领导角色,以及最近Atherotech诊断。陈是在液体活检领域的先驱,Circulogene的核心技术的发明者。

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